Главная

Контакты

Случайная статья

• Автоматизация
• Антропология
• Археология
• Архитектура
• Биология
• Ботаника
• Бухгалтерия
• Военная наука
• Генетика
• География
• Геология
• Демография
• Деревообработка
• Журналистика
• Зоология
• Изобретательство
• Информатика
• Искусство
• История
• Кинематография
• Компьютеризация
• Косметика
• Кулинария
• Культура
• Лексикология
• Лингвистика
• Литература
• Логика
• Маркетинг
• Математика
• Материаловедение
• Медицина
• Менеджмент
• Металлургия
• Метрология
• Механика
• Музыка
• Науковедение
• Образование
• Охрана Труда
• Педагогика
• Полиграфия
• Политология
• Право
• Предпринимательство
• Приборостроение
• Программирование
• Производство
• Промышленность
• Психология
• Радиосвязь
• Религия
• Риторика
• Социология
• Спорт
• Стандартизация
• Статистика
• Строительство
• Технологии
• Торговля
• Транспорт
• Фармакология
• Физика
• Физиология
• Философия
• Финансы
• Химия
• Хозяйство
• Черчение
• Экология
• Экономика
• Электроника
• Электротехника
• Энергетика

Задание 2: Поиск определенного конечного фрагмента в сетке.

Задание 2: Поиск определенного конечного фрагмента в сетке.

Инструменты: программа IsoCryst, фильтры DBMS.

Пример: поиск полиморфных модификаций гидрохинона.

Алгоритм:

(1) Снова откройте окно программы IsoCryst и нарисуйте молекулу гидрохинона. Выделите ее.

(2) Выполните команду Select/Save Selection и выберите тип файла Graph files (*.gph). Напечатайте имя hydroquinone и сохраните данные. ВАЖНО! По умолчанию файлы *.gph запоминаются в каталог GPH, который может быть задан в разделе System/TOPOS Parameters (смотрите также Приложение 9).

(3) Закройте окно программы IsoCryst.

(4) Выберите Filters/Topology/Subgraph, нажмите кнопку Load и загрузите файлhydroquinone.gph.

Нажмите кнопку View, чтобы посмотреть на молекулу. Закройте окно программы IsoCryst.

(5) Нажмите кнопку Ok. Найдено четыре полиморфных модификации гидрохинона из 11 C₆H₆O₂ соединений.

(6) Выберите вторую полиморфную модификацию из списка, откройте окно программы IsoCryst и выполните команду Select/Load Tint File. Выберите Graph files (*.gph) и загрузите файл hydroquinone.gph. Будет открыто окно карточки Tint file data. В структуре есть три независимых молекулы гидрохинона. Выполните команду Growth в окне программы IsoCryst до тех пор, пока все три записи не будут выделены жирным шрифтом.

Выделите все три записи (щелчок мышью и клавиша Ctrl или щелчок мышью и клавиша Shift), установите Options: Hide all atoms и нажмите кнопку Apply.

В окне программы IsoCryst будут выделены три молекулы (желтым цветом).

Закройте окна карточки Tint file data и программы IsoCryst.

Примечание: Опция: Hide none – останется изображение всех молекул и три из них будут выделены желтым цветом. Опция: Hide all atoms – в окне программы IsoCryst останется изображение только трех молекул, выделенных желтым цветом.

(7) Выделите все четыре записи в базе данных и скопируйте их в новую базу данных Quinol.

Упражнение: проведите поиск произвольного фрагмента в Ваших собственных структурах.