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« Artemisia » : un projet d’amélioration génétique d’Artemisia annua



« Artemisia »: un projet d’amé lioration gé né tique d’Artemisia annua

Sé lection gé né tique basé e sur l’acquisition de caractè res

Le moteur du progrè s gé né tique é tant la variabilité, la straté gie dé veloppé e par le projet « Artemisia » a consisté à s’appuyer conjointement sur la variabilité naturelle et la variabilité induite par mutagenè se pour identifier des plantes à rendement é levé en arté misinine afin de cré er de nouvelles varié té s (Figure 2). L’espè ce Artemisia annua se reproduit majoritairement par fé condation croisé e. Les individus qui la composent sont gé né ralement trè s hé té rozygotes, ce qui explique la grande variabilité des populations issues de leurs croisements. C’est le cas de la varié té Artemis, l’hybride F1 qui a actuellement le meilleur rendement et est dé veloppé par Mediplant (Conthey, Suisse). Celle-ci a logiquement constitué la population de dé part pour le projet Artemisia: à partir de cette varié té ont é té é tablies d’une part une population mutante obtenue par traitement chimique et autofé condation, et d’autre part une population de cartographie gé né tique comprenant 242 gé notypes.

Figure 2 Sché ma de la straté gie mise en œ uvre par le projet « Artemisia » pour la cré ation de varié té s à haut rendement en arté misinine. ADNc: ADN complé mentaire; ES expressedsequence tag; QTL: quantitative trait loci

Afin de dé velopper des outils molé culaires, des feuilles et fleurs d’Artemis, ainsi que des plantes provenant de populations traditionnellement cultivé es en Afrique et en Asie du Sud-Est (populations M et U), ont é té collecté es pour construire des banques d’ADN complé mentaire (ADNc). Des sé quences de type EST (expressedsequence tag) ont é té produites à partir de ces banques par pyrosé quenç age et leur analyse bio-informatique (alignements et comparaisons) a permis d’identifier plus de 100 000 polymorphismes de sé quences. À partir de ces polymorphismes, prè s de 800 marqueurs molé culaires ont é té sé lectionné s. L’analyse de leur sé gré gation dans la population de cartographie a permis d’é tablir les deux premiè res cartes gé né tiques de l’espè ce Artemisia annua, chacune correspondant aux parents d’Artemis. La population de cartographie a é galement fait l’objet d’une é valuation phé notypique dans diffé rents environnements afin d’analyser la variabilité gé né tique de caractè res pouvant avoir un impact sur le rendement final en arté misinine. Les caractè res ciblé s é taient la croissance et l’architecture de la plante, la morphologie foliaire, la densité de trichomes sur les feuilles et la concentration en arté misinine dans les feuilles. L’analyse des donné es a montré d’une part que ces caractè res é taient transmissibles hé ré ditairement, c’est-à -dire qu’une part relativement importante de leur variation est d’origine gé né tique, et d’autre part qu’ils n’é taient pas tous corré lé s. Cela dé montre qu’il est possible d’amé liorer le rendement global en arté misinine en ciblant la sé lection sur ces caractè res cibles. Cependant, la sé lection gé né tique basé e sur l’acquisition de caractè res demeure coû teuse et relativement longue puisqu’elle requiert l’é valuation de nombreuses plantes dans de multiples dispositifs expé rimentaux.



  

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