Инструментарий Национальная медицинская библиотека США

Инструментарий Национальная медицинская библиотека США

NCBI Национальный центр биотехнологической информации

NCBI предоставляет несколько инструментов для загрузки пользовательских наборов данных.

Войдите в утилиты программирования (электронные утилиты)

Электронные утилиты являются общедоступным API для системы NCBI Entrez и обеспечивают доступ ко всем базам данных Entrez. включая PubMed, PMC, Gene, Nuccore и Protein. Электронные утилиты представляют собой набор из восьми серверных программы, которые принимают фиксированный синтаксис URL для операций поиска, ссылки и поиска. Сопутствующий пакет под названием Entrez Direct состоит из нескольких исполняемых файлов, которые позволяют вызывать E-утилиты непосредственно из командная строка UNIX.

· Документация

· Быстрый старт

· Примеры

· Войти прямо

Инструментарий SRA

Набор инструментов SRA - это набор скомпилированных двоичных файлов и соответствующего исходного кода для инструментов, которые загружают, манипулируют и проверить данные секвенирования следующего поколения, хранящиеся в архиве NCBI SRA. Бинарные файлы доступны для Windows, Mac. Платформы OS X и LINUX.

· Документация

· Скачать

· Схема XML

GEO2R

GEO2R - это инструмент анализа, который идентифицирует гены, которые по-разному экспрессируются в экспериментальных условиях с помощью сравнение двух или более образцов из наборов данных GEO. Результаты представляют собой таблицу генов, которую можно скачать.

· GEO2R

· Документация

ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ССЫЛКИ

· Политика использования данных

· ASN. 1 Технические характеристики

· Войти в NCBI

· END