- Автоматизация
- Антропология
- Археология
- Архитектура
- Биология
- Ботаника
- Бухгалтерия
- Военная наука
- Генетика
- География
- Геология
- Демография
- Деревообработка
- Журналистика
- Зоология
- Изобретательство
- Информатика
- Искусство
- История
- Кинематография
- Компьютеризация
- Косметика
- Кулинария
- Культура
- Лексикология
- Лингвистика
- Литература
- Логика
- Маркетинг
- Математика
- Материаловедение
- Медицина
- Менеджмент
- Металлургия
- Метрология
- Механика
- Музыка
- Науковедение
- Образование
- Охрана Труда
- Педагогика
- Полиграфия
- Политология
- Право
- Предпринимательство
- Приборостроение
- Программирование
- Производство
- Промышленность
- Психология
- Радиосвязь
- Религия
- Риторика
- Социология
- Спорт
- Стандартизация
- Статистика
- Строительство
- Технологии
- Торговля
- Транспорт
- Фармакология
- Физика
- Физиология
- Философия
- Финансы
- Химия
- Хозяйство
- Черчение
- Экология
- Экономика
- Электроника
- Электротехника
- Энергетика
Запуск задач в пакетном режиме на кластере HybriLIT. Инструкция
Запуск задач в пакетном режиме на кластере HybriLIT. Инструкция
Для пакетного запуска задач необходимо создать скрипт-файл. Это можно это сделать прямо на кластере, пользуясь редактором nano или vim.
Название и расширение скрипт-файла может быть произвольным. Обычно используют расширение .sh либо название файла без расширения.
Простейший скрипт для запуска MPI-приложений имеет вид:
· Ключ «-р» во 2й строке указывает, в какую очередь поставить задачу, см. сайт HybriLIT для информации о доступных очередях. Мы используем очередь для учебных целей «tut» (от слова tutorial) либо очередь «cpu».
· Ключ «-n» в 3й строке – количество требуемых параллельных процессов
· Ключ «-t» в 4й строке – запрашиваемое время выполнения задачи. Здесь задается 1 минута. Этого за глаза хватит для всех задач в рамках курса АВС.
· Последняя строка – команда запуска того исполняемого файла, который присутствует в папке на момент запуска.
Команда запуска программы на счет c помощью скрипта с именем script_mpi:
sbatch script_mpi
При корректном запуске появляется строка Submitted job с номером задачи (jobid).
Результаты выполнения программы выводятся не на экран, а в файл с именем slurm-<jobid>.out, где после дефиса стоит номер задачи, высвеченный ранее на экране.
Увидеть файл можно, просмотрев содержимое папки с помощью линукс-команды ls.
Просмотр содержимого slurm-файла осуществляется с помощью редактора (nano) либо с помощью линукс-команды cat.
Запуск, просмотр папки и просмотр файла показаны на скриншоте:
Здесь задаче присвоен номер 317480, в папке появляется соответствующий файл, вызвана команда просмотра этого файла, виден результат работы программы: в данном случае это всего одна строка «rank=0, S=10».
Примечание 1. Если файл с результатами долго не появляется, это может означать, что программа «висит» или циклится, т.е. ее работа может продолжаться, пока не истечет заявленное время. Также может оказаться, что задача ожидает в очереди и не идет на счет из-за большой загрузки кластера.
Проверить это можно с помощью команды squeue:
В таблице задач указывается номер задачи, тип очереди (здесь cpu и long), имя скрипта, login пользователя, статус задачи: R – работает, PD – ожидает в очереди, время работы, количество узлов.
Убрать свою задачу пользователь может с помощью команды scancel с указанием номера задачи. Например, командой
|
|
|
© helpiks.su При использовании или копировании материалов прямая ссылка на сайт обязательна.
|